به علت خطرناک بودن هرگونه آلودگی در اتاق عمل علاوه بر استریل وسایل اتاق عمل، باید هوای داخل اتاق نیز فاقد هرگونه آلودگی و میکروب باشد. بدین منظور از سیرکولاسیون هوای اتاق عمل میباید اجتناب نمود و باید صددرصد هوای تازه فیلتر شده (توسط فیلترهای کیسه ای، فیلترهای هپا و …) را با فشار مثبت وارد اتاق نمود و سپس با تعبیه فنهای اگزاست، هوای ورودی را سریعاً تخلیه نمود. استفاده از اسپلیت نوع دیواری به دلیل سیرکولاسیون پیوسته هوا در اتاق عمل ممنوع میباشد.
جهت تهویه اتاق عمل میبایست از دستگاه هواساز (هوارسان) هایژنیک یا پکیج یونیت پشت بامی با افت اکسترنال فن حدود 2 اینچ آب استفاده نمود.